Выделять ли в платежных поручениях НДС при перечислении средств агенту от субагента?

Корректно будет разделить перевозки на МВЛ и ВВЛ и перечислить, соответственно, МВЛ – в т.ч. НДС 0%, ВВЛ – в т.ч. НДС 18%. Если же это не представляется возможным,  и перечисление включает в себя перевозки как по МВЛ так и ВВЛ, то сумму НДС по ВВЛ желательно выделить в назначении платежа.

Письмо Минфина от 16 марта 1999 г. N 04-03-11ф было актуально в период, когда НДС в перевозочных документах отдельной строкой не выделялся. На данный момент эта проблема решена, и, на наш взгляд, безопаснее и правильнее НДС по ВВЛ выделить в назначении платежа.